Técnicas para medición específica de interacción de ácido nucleico con otro ácido nucleico o con una proteína por digestión de ácido nucleico no interactivo por varias nucleasas. Después de todo las regiones no interactivas son eliminadas por digestión de nucleasa, y se analiza el ácido nucleico protegido que permanece. HUELLA DE ADN utiliza esta técnica para analizar los sitios de contacto de ADN de las PROTEINAS DE ENLACE DE ADN