Un dominio de transmembrana que contienen metaloproteinasas de matriz. Se sintetiza como un zimógeno inactivo que se activa por la acción proteolítica de PROTEINAS CONVERTASAS. La metaloproteinasa de matriz 16 tiene un rol directo en la escisión de proteínas en el entorno pericelular. Además, puede funcionar indirectamente por la activación enzimática de la forma proproteína de otras METALOPROTEINASAS DE LA MATRIZ, tales como el zimógeno de la METALOPROTEINASA DE LA MATRIZ 2.