Es un aminoácido formado in vivo por la degradación del dihidrouracil y la carnosina. En vista de que la captación neuronal y la sensibilidad receptora neuronal a la beta-alanina han sido demostradas, el compuesto puede ser un transmisor falso, sustituto de GABA. Ha sido descrito un raro trastorno genético conocido como hiper-beta-alaninemia.